La PCR Variant es troba a disposició del pacient a les clíniques de Cetir Ascires i com a kit per a hospitals i centres de salut
Un nou test genètic permet identificar fins a cinc possibles variants del SARS-CoV-2 inicial originat a la Xina. Són les variants del coronavirus de major impacte en la salut pública: alfa, beta, gamma, delta i delta plus (conegudes també com a britànica, sud-africana, brasilera i índies, respectivament). Es tracta de la nova PCR Variant d’Ascires Sistemas Genómicos, laboratori del grup biomèdic del qual forma part la catalana Cetir. Mitjançant aquesta PCR, es duu a terme un genotipatge de la mostra positiva per coronavirus per identificar alguna d’aquestes cinc variants com a agents causants de la infecció.
Conèixer la variant del contagi és molt rellevant a nivell clínic i epidemiològic, així com de cara a l’entorn personal o familiar del pacient. Les cinc soques esmentades –principalment, la delta i la delta plus– es relacionen amb una major transmissibilitat, ja que totes inclouen una mutació en la proteïna de l’espícula (clau d’entrada en la cèl·lula humana) que augmenta la seva capacitat de propagació.
A més, la variant britànica (ja majoritària a Espanya), l’índia i la brasilera s’associen, cosa que incrementa la gravetat del virus respecte de la soca nativa, segons els indicis recollits en diferents estudis científics. Per la seva banda, la sud-africana i la delta plus es caracteritzen per una major capacitat per escapar de l’acció dels anticossos generats després de la infecció natural o per determinades vacunes.
“Des de la perspectiva mèdica, conèixer la variant que provoca la infecció ens proporciona una informació molt valuosa, ja que ens permet personalitzar l’atenció clínica. Si es tracta d’una soca que s’associa a una major gravetat de la malaltia, podem intensificar el seguiment del pacient o establir un control més rigorós a través de proves complementàries d’imatge, per exemple”, exposa la doctora Amparo García, de l’equip mèdic d’Ascires.
Si es tracta d’una variant més transmissible, caldria extremar –encara més, si cal– totes les mesures de protecció de cara a l’entorn personal i familiar del pacient. A més, així com una informació més precisa sobre les variants del virus resulta útil a nivell clínic per al pacient afectat, també modula les pautes oficials de salut pública.
Quarantena per a contactes estrets, fins i tot vacunats
Segons ha establert recentment el Ministeri de Sanitat, tots els contactes estrets –també aquells amb pauta completa de vacunació o que hagin passat la Covid en els 6 mesos previs– d’una persona infectada per les variants beta, gamma o delta hauran de guardar quarantena. Aquest canvi de protocol, recollit en l’actualització de l’estratègia de detecció precoç, vigilància i control de Covid-19 del Ministeri, es relaciona amb “el major risc de fuita immunitària” de les variants sud-africana, brasilera i índia. No obstant això, si es tracta d’un contagi per variant alfa (britànica), els contactes estrets vacunats amb pauta completa o que hagin passat la Covid en els últims 6 mesos no estan obligats a confinar-se.
Clau davant la sospita de reinfecció
Així, la identificació de la variant que ha generat el contagi és també clau en els casos de “sospita de reinfecció o qualsevol altre fenomen de fuita a la resposta immune”, tal com estableix el Ministeri de Sanitat en el protocol d’Integració de la Seqüenciació Genòmica en la Vigilància del SARS-CoV-2.
“En els casos de pacients que han passat la Covid fa més de 90 dies o que ja han estat vacunats i donen positiu en una PCR, seria molt important la identificació de la variant que ha provocat la nova infecció per ajudar-nos a comprendre el procés i l’abordatge d’aquesta”, argumenta la doctora García.
L’anàlisi de la variant es realitza sobre la mostra nasofaríngia o de saliva que ha donat positiu per coronavirus en qualsevol de les proves moleculars que ofereix Ascires: PCR Multiplex (convencional), PCR Fast (ràpida) i PCR Saliva. Sobre aquesta mostra positiva, es fa una segona PCR (PCR Variant) per detectar les mutacions que han donat origen a les cinc variants del virus.
Aquest servei també està disponible en format kit perquè hospitals i centres de salut especialitzats desenvolupin l’anàlisi de genotipatge amb les seves pròpies mostres.
